A kert védett területe, gazdag, változatos növényanyaga különféle állatoknak is nagyszerű élőhelyet biztosít.
Az emlősök közül csak a rágcsálók (mókus, mogyoróspele), a kisragadozók (nyest, menyét, róka, vidra), és a rovarevők (sün, cickányok és több denevérfaj) képviseltetik magukat, hiszen a kert fallal van kerítve.
Az eddigi megfigyelések alapján 62 madárfaj fészkelése bizonyított a kertben. Jellemzők a rigók, cinkék, harkályok, poszáták, füzikék, baglyok, fülemüle, erdei pinty, zöldike, csóka, örvös galamb, a tavakban tőkés réce. Néhány már ritkaság számba menő madárral is találkozhatunk: szalakóta, füleskuvik, jégmadár, fekete harkály. Ellenőrzött mesterséges odútelep és rendszeres téli etetés is segíti a madarak megtelepedését.
A kert több sikló- és gyíkfajnak ad otthont és sok békafaj is megtalálja lakóhelyét és szaporodási lehetőségét a tavakban.
A patakban és a tórendszerben 22 megtelepedett halfaj élvezi a védettséget.
A változatos növényzet rendkívül gazdag rovarvilágot eredményez, ezt az is segíti, hogy csak a legminimálisabb növényvédelmi tevékenység folyik a területen. Egy feltáró vizsgálat alapján kiderült, hogy 73 vízi és szárazföldi puhatestű faj (kagyló és csiga) él a Kertben.
Az állatvilág szervesen illeszkedik a gyűjtemények növényanyagához, teljes védelmet élvez.
A figyelmes látogató állati nyomokkal is találkozhat. Ez lehet egy-egy lábnyom, vagy megrágott dió, mogyoró. Számos jel árulkodik a Kert gazdag állatvilágáról.